Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Irf1P15314 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Irf1P15314 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Irf1P15314 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Irf1P15314 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Irf1P15314 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Irf1P15314 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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