Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa1P11477 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms