Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms