Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ifna9P09235 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms