Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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