Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01638 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01638 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01638 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms