Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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