Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops6O88545 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cops6O88545 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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