Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms