Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChkaO54804 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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