Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CrxO54751 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms