Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms