Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clk2O35491 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms