Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Prrt1O35449 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms