Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ColqO35348 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ColqO35348 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ColqO35348 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms