Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Degs1O09005 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Degs1O09005 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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