Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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