Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms