Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms