Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3542K7N6U2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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