Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc180J3QNE4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc180J3QNE4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms