Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmem200cJ3QK46 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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