Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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