Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms