Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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