Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arid4aF8VPQ2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms