Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms