Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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