Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms