Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms