Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms