Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms