Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SafbD3YXK2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SafbD3YXK2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms