Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Syce3B5KM66 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syce3B5KM66 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syce3B5KM66 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syce3B5KM66 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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