Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms