Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms