Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms