Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms