Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbp4A4UUI3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms