Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms