Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms