Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ckap5A2AGT5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms