Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb4A2A863 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb4A2A863 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb4A2A863 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb4A2A863 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb4A2A863 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb4A2A863 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Itgb4A2A863 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Itgb4A2A863 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itgb4A2A863 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itgb4A2A863 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Itgb4A2A863 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb4A2A863 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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