Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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