Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Crlf3Q9Z2L7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Crlf3Q9Z2L7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Crlf3Q9Z2L7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Crlf3Q9Z2L7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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