Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms