Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms