Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms