Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nme3Q9WV85 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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