Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh11Q9QYF1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rdh11Q9QYF1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rdh11Q9QYF1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rdh11Q9QYF1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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